Pri tem naj bi bilo predvsem vprašljivo njegovo sodelovanje s prvim zvezdnikom moštva Lionelom Messijem. Zato so se v javnosti začela pojavljati namigovanja, da je med njima najbrž prišlo do nesoglasij. Oba akterja zgodbe o tem nista želela govoriti, predsednik kluba Josep Bartomeu pa je celo (večkrat) zatrjeval, da je vse v najlepšem redu. Vendar temu očitno vendarle ni tako.
Zdaj je o omenjeni zadevi spregovoril branilec katalonskega velikana Jeremy Mathieu, ki je razkril, da sta se Enrique in Messi v začetku meseca na enem izmed treningov res sporekla. Vse skupaj pa se je zgodilo kmalu po tem, ko se je Argentinec vrnil z božično-novoletnega dopusta. Po tem pa ga je Enrique v dvoboju z Real Sociedadom še posedel na klop. Za nameček je Barca srečanje izgubila z 1:0.
Pozneje je bilo še veliko govora o tem, da bi Messi utegnil zamenjati delodajalca. Povezovalo se ga je z odhodom v Chelsea, a so te govorice zdaj nekoliko potihnile.
"Zgodilo se je, ko se je Messi vrnil z oddiha v domovini. Kar naenkrat je Leo na treningu povsem znorel, ko ni bil dosojen prekršek nad njim. Bilo je zelo napeto in z Enriquejem sta si izmenjala nekaj zelo ostrih besed. Po koncu treninga je Luis Enrique v slačilnici pristopil do njega, pogovorila sta se, in to je bilo to," je dejal Mathieu, ki je dodal, da se takšne stvari dogajajo v vseh klubih, ampak je bilo v tem primeru veliko pretiravanja, saj gre navsezadnje za Barcelono. "Največja težava pri tem je, da so stvari prenapihnjene," je zaključil Mathieu.